La relación entre Margaret Shelton y Thomas Clere no está clara, ya que hay diferentes versiones de los hechos. Algunos historiadores creen que Margaret Shelton fue la amante del rey Enrique VIII y que Thomas Clere mantuvo una relación más platónica con ella. Sin embargo, otros sostienen que Margaret fue la amante de Thomas, y que incluso tuvo uno o dos hijos con él. En cualquier caso, lo que sí se sabe es que tanto Margaret como Thomas eran parte de la corte del rey Enrique VIII. Margaret fue una de las damas de compañía de la reina Ana Bolena, que era la segunda esposa del rey. Thomas, por su parte, era el secretario de la Embajada inglesa en el extranjero y fue enviado a España para tratar de negociar el divorcio del rey con Catalina de Aragón. En 1535, Thomas regresó a Inglaterra y se convirtió en uno de los confidentes más cercanos del rey. Se dice que incluso se alojó en la casa de Enrique VIII en Greenwich, donde pudo haber conocido a Margaret. No se sabe con certeza cómo comenzó la relación entre Margaret y Thomas, pero algunos sugieren que se conocieron en la corte durante los años que ambos sirvieron a la reina Ana Bolena. Lo que sí se sabe es que la relación entre ambos fue descubierta por el rey, lo que llevó a que Margaret fuera enviada a un convento en 1538. Después de su encarcelamiento, Thomas envió varias cartas a Margaret tratando de mantener contacto con ella. Esas cartas, junto con otras evidencias, como un testamento que dejó a sus posibles hijos, han llevado a algunos historiadores a sugerir que Thomas y Margaret tuvieron una relación íntima. En resumen, la relación entre Margaret Shelton y Thomas Clere sigue siendo un misterio, pero lo que se sabe es que ambos eran parte de la corte de Enrique VIII y que su relación fue descubierta por el rey.
